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AppleとGenetech社がNCBIのBLAST(Basic Local Alignment Search Tool)をハックして作ったApple/Genetech BLAST。存在は知っていたけど、どうやら最高5倍の速さで動くらしいので、入れてみることにした。クロックサイクルあたり複数の浮動小数点計算ができるVelocity Engineを搭載するG4/G5プロセッサのみに適用できるらしい。現在v.2.2.9でファイルサイズが12.8MB。アップデートもしてるみたいだ。ここからダウンロードしてきて

$ gunzip blastall-2.2.9.gz 
$ chmod a+x blastall 
$ mv -f blastall /bio

で、既存のtoolboxを書き換えるだけ。 大量検索の時に役に立つだろうか・・・。